Дополнительные доходы предлагается направить на сокращение дефицита федерального бюджета, который составит в 2013 году 480,9 миллиарда рублей, или 0,7 процента ВВП (против 0,8 процента, утвержденных законом о бюджете на 2013 год).
Законопроект предусматривает увеличение нефтегазовых доходов на 546,4 миллиарда рублей и уменьшение ненефтегазовых доходов на 505,9 миллиарда рублей. Дополнительные нефтегазовые доходы сложились в основном за счет увеличения прогноза мировых цен на нефть марки Urals с 97 до 107 долларов за баррель. Снижение ненефтегазовых доходов связано с сокращением объемов импорта и экспорта, прибылей организаций, а также с изменением налоговой базы по НДС.
Согласно законопроекту, правительство РФ получает право в 2013 году направлять на покрытие дефицита бюджета дополнительные нефтегазовые доходы, подлежащие зачислению в Резервный фонд. В случае их недостатка дефицит может быть покрыт непосредственно из средств Резервного фонда в объеме до 200 миллиардов рублей.
При этом деньги направляются на ликвидацию последствий крупномасштабного наводнения на территории Дальневосточного федерального округа. Также правительство в 2013 году получит право реструктурировать задолженность субъектов РФ по кредитам, предоставленным для ликвидации последствий наводнения на Дальнем Востоке.
Кроме того, например, "Российские железные дороги" получат средства для развития и модернизации БАМа и Транссиба, а также на инвестпроект по реконструкции ж/д участка станция М.Горького - Котельниково - Тихорецкая - Крымская с обходом Краснодарского железнодорожного узла. При этом поправками на один миллиард рублей сокращается финансирование строительства высокоскоростной магистрали Москва-Казань.