Традиционно считается, что назначение и.о. - пролог к министерской должности. В стенах Минпромнауки у Фурсенко немало приверженцев, которые называют его "самой светлой головой" ведомства. Андрей Александрович начинал свою карьеру в Санкт-Петербурге, а во власть пришел из науки. Был одним из создателей в России венчурного сообщества - общественных организаций, занятых привлечением прямых инвестиций в сферу высоких технологий. В министерстве стараниями Фурсенко это направление работы стало одним из важнейших. Кроме того, он курирует еще целый ряд сложных тем, к которым общество, власть и бизнес относятся неоднозначно. К их числу можно отнести, к примеру, проект закона об офшорных зонах и целый ряд положений Закона о гостайне.
Многие утверждают, что есть другой претендент в стенах самого ведомства - другой первый заместитель министра Андрей Свинаренко. Считается, что у него достаточно политического и управленческого опыта - в Минпромнауки Свинаренко пришел с поста заместителя Павла Бородина - государственного секретаря Союза России и Белоруссии.
В последнее время появилась и еще одна версия: вице-премьер Борис Алешин, который курирует промышленность и науку, возможно, будет совмещать эту работу с должностью министра, так же, как другой вице-премьер Алексей Кудрин одновременно является и главой Минфина. Борис Алешин возглавляет Правительственную комиссию по административной реформе, и ему проще, чем другим претендентам, будет отстоять министерство, которое, в процессе этой самой реформы, некоторые предлагают ликвидировать, передав его функции другим ведомствам.