Кроме того, согласно постановлению правительства, в структуре центрального аппарата минпромэнерго разрешается иметь до 13 департаментов по основным направлениям деятельности. Пока их число равняется 12.
До недавнего времени у министра Виктора Христенко было три заместителя: Андрей Дементьев, Денис Мантуров и Иван Матеров, являющийся статс-секретарем. В октябре этого года глава департамента государственной энергетической политики Анатолий Яновский был назначен четвертым заместителем главы минпромэнерго. А летом прошла последняя реорганизация в министерстве, когда на базе департамента ТЭК было образовано три новых департамента.