По словам представителя СК РФ Владимира Маркина, на исходе лета 2015 года ректор дал указание проректорам по науке и инновациям Алексею Цхе и экономике и финансам Виктору Атаманюку подписать акты сдачи-приемки исполнения обязательств по третьему этапу создания в вузе информационно-технической системы "Электронный университет". А 15 сентября 2015 года поручил главному бухгалтеру на их основании перечислить 20 миллионов рублей исполнителю. Проректоры Цхе и Атаманюк задержаны накануне и 16 марта посажены под домашний арест.
Система "Электронный университет" должна была, например, обеспечить функционирование электронной библиотеки, начисления стипендий, оплату проживания в общежитии, регистрацию для участия в конференциях и прочее. А ключом студента и сотрудника ко всем этим возможностям стала кампусная карта, которая и средство идентификации личности студента, и универсальное платежное средство.