Комплекс, расcчитанный на 1100 мест, включает два больших спортивных зала и один малый, хореографический зал, библиотеку с читальными залами, музей, актовый зал, столовую. Здесь организованы пять лабораторий, студии звукозаписи, профессиональной фотографии, театральная студия. Для детей с особенностями здоровья создана безбарьерная среда. На территории школы обустроены хоккейная, волейбольная, баскетбольная площадки, полоса препятствий, теплица, детские площадки, автогородок.
Гимназия №3 - стратегически важный для региона объект социальной инфраструктуры Новосибирского научного центра. Она входит в число ста лучших школ России по конкурентоспособности выпускников и по информационно-коммуникационным технологиям, а также в топ-300 лучших школ страны по количеству выпускников, поступивших в ведущие вузы России, и в топ-20 лучших школ Сибири.
Строительство нового здания велось в рамках реализации национального проекта "Образование" и государственной программы Новосибирской области "Развитие образования, создание условий для социализации детей и учащейся молодежи в Новосибирской области".
Выступая на торжественной линейке в гимназии №3, губернатор отметил, что ученики, педагоги, родители, выпускники давно мечтали о комфортных условиях для детей и учителей. По словам Андрея Травникова, решение построить новое, современное и вместительное здание было принято три года назад на встрече с директором, учителями и родительским комитетом школы. "Сегодня, еще раз обойдя территорию школы, я осознал, какой сложный путь пришлось пройти. Насколько непросто было вписать современное здание в плотную, историческую застройку Академгородка. Поздравляю всех с тем, что это удалось", - подчеркнул глава региона.