С 1987-го по 1996 год, в период распада СССР и становления постсоветской России, он возглавлял органы исполнительной власти региона. Вначале был председателем областного исполнительного комитета, затем главой администрации региона. Василий Десятников также был членом Совета Федерации, где занимал пост председателя комитета по международным делам.
В 1996 году проиграл прямые выборы на должность руководителя региона, после чего фактически покинул Вятку. Занимал должность заместителя министра природных ресурсов РФ. В 1998 году стал депутатом Государственной думы от Саратовской области.
Губернатор Александр Соколов выразил соболезнования родным и близким Василия Десятникова, сообщает пресс-служба Кировской области.