В Союзном государстве действует единое таможенное пространство, в отношении которого применяются: единый порядок экспортного контроля; единые меры нетарифного регулирования, включая применение количественных ограничений, лицензирование ввоза и вывоза товаров, ведение единого перечня товаров, к которым применяются запреты или ограничения ввоза и вывоза; единый порядок взаимного признания лицензий, сертификатов и разрешений на ввоз или вывоз товаров.
22 июня 1996 года создан Таможенный комитет Сообщества, который переименован в Таможенный комитет Союзного государства. В нем образована коллегия, в состав которой входят председатель Таможенного комитета СГ (председатель коллегии), его заместители, а также руководящие работники центральных таможенных органов государств - участников Союзного государства. В 2022 году завершена работа по реализации российско-белорусской Союзной программы по гармонизации налогового и таможенного законодательства и сотрудничеству в таможенной сфере. Вступил в действие Договор о гармонизации таможенного законодательства и сотрудничестве в таможенной сфере, основными направлениями являются: информационное взаимодействие, контроль, категорирование участников ВЭД и унификация институтов УЭО.