Муратов родился в 1935 году в Харькове в семье писателя Игоря Муратова. Окончил режиссерский факультет ВГИКа в 1959-м. Работал на киностудии имени Горького, на Одесской киностудии, с 1967 года - на Киевской киностудии имени Довженко.
В 1964-м вместе с Кирой Муратовой снял фильм "Наш честный хлеб", в 1966 году - первую самостоятельную картину "Авдотья Павловна".
Снимал художественные и документальные фильмы. Один из самых известных - проект 1982 года "Гонки по вертикали", по сценарию братьев Вайнеров.
В списке лент - "Весенний дождь", "У крутого яра" (дипломная работа), "Та самая ночь", "Старая крепость", "Золотая цепь", "Осенние утренники", "Любаша", десятки других.
О смерти постановщика сообщили СМИ Украины.