Сергей Валерьевич был зачислен в отряд в 2012 году. Он совершил 2 космических полета (в 2018-м и 2022-2023 годах) суммарной продолжительностью более 567 суток. Во время экспедиций на МКС он 8 раз выходил в открытый космос, в общей сложности проработав вне орбитального дома 55 часов 14 минут.
За мужество и героизм, проявленные при осуществлении длительного космического полета на Международной космической станции, Указом президента Российской Федерации в 2019 году Сергею Прокопьеву присвоено звание Героя России, летчика-космонавта РФ.