По их мнению, будучи главой "Фронтекс" (2015-2022), тот вел "политику, направленную на препятствование любой ценой въезду мигрантов в ЕС". Агентство активно использовало средства раннего обнаружения судов, чтобы их могли перехватить корабли береговой охраны Италии, Мальты или Ливии. Глава Лиги прав человека Патрик Бодуэн заявил газете Le Monde, что линия Лежери на отказ в приеме мигрантов была незаконной и привела к гибели тысяч людей во время попыток пересечь Средиземное море.
Согласно статистическим данным, как минимум 82 тысячи беженцев погибли или пропали без вести с 2014 года. 34 тысячи из них погибли именно в Средиземном море. И этот маршрут, по данным Международной организации по миграции, стал самым смертоносным в мире.
С такими обвинениями Лежери сталкивался и когда возглавлял европейское пограничное агентство, однако только сейчас его обвинители смогли добиться назначения судьи, который будет вести расследование. "Впервые один или несколько французских следственных судей рассмотрят условия потенциальной уголовной ответственности Фабриса Лежери", - отметил юрист правозащитников Эммануэль Дауд.
Представители Лежери отметили, что евродепутат еще не был проинформирован об этих обвинениях, и потому не может давать комментарии.
Однако в 2024 году он отвергал уже все обвинения, заявлял, что они направлены на его дискредитацию в качестве члена "Национального объединения", именно эту французскую партию он сейчас представляет в Европарламенте.