В ноябре 2025 года Ленинский районный суд Уфы признал Марзаева виновным в получении взятки. Его приговорили к 13 годам строгого режима и штрафу в 561 миллион рублей. Экс-чиновнику запретили занимать госдолжности на 12 лет, конфисковали участок, два дома и сумму взятки в 37 миллионов рублей.
Верховный суд Башкирии в феврале оставил приговор без изменений.
Марзаев не признал вину, назвав приговор результатом оговора и предвзятости суда и следствия.