Администрация канала обычно взимает фиксированную плату за зарезервированную дату прохода. Кроме того, проводятся ежедневные аукционы, на которых судоходные компании могут выставлять на торги места в очереди.
Начальные ставки составляют около 13 тыс. евро для небольших грузовых судов и около 48 тыс. евро для самых крупных. Однако при высоком спросе цены могут резко возрасти. Судоходная компания заплатила около 3,5 млн евро, чтобы ее контейнеровоз мог обойти очередь.
Помимо вооруженного конфликта на Ближнем Востоке, из-за которого пришлось перераспределять логистические маршруты и в Панамском канале увеличился трафик судов, проблемы создают и погодные условия. Уровень воды в канале снижается из-за набирающего силу явления Эль-Ниньо. Искусственное озеро Гатун, которое обеспечивает канал водой, дает ее в меньшем объеме.
Администрация канала уже в июле снизила максимально допустимую осадку для судов: крупные суда будут перевозить меньше грузов. В конце августа и начале сентября должны быть введены дополнительные ограничения на осадку.