Когда налогоплательщику не хватает денег для уплаты НДС в бюджет с НДС-счета, он может быть пополнен с расчетного счета. Таким образом, каналом наполнения НДС-счета будут денежные средства на расчетных счетах.
Базовым условием, при котором работает эта система, является то, что право на вычет при формировании налогового обязательства при уплате НДС в бюджет предоставляется только по тем суммам, которые прошли через НДС-счет. То есть если наш контрагент не имеет НДС-счета, то мы не можем предъявить к вычету суммы НДС, которые получили от него. Только деньги, "окрашенные" в системе НДС-счетов, дают право на вычет. Забрать деньги с НДС-счета можно будет только в случае ликвидации предприятия.
В данной системе предполагается очень высокая ответственность кредитных организаций, банков за функционирование этой системы. Потому что налогоплательщик по ошибке может поручить банку списать деньги с НДС-счета на расчетный счет, и банк не должен проводить такую проводку. Банки должны будут сообщать в налоговые органы об операциях, прошедших через НДС-счета. И наконец, ЦБ должен будет наладить такое эффективное регулирование системы банковских организаций, которое не позволит создавать специализированные "НДС-банки", накапливать в них деньги на НДС-счетах, а потом искусственно обрушивать, естественно вместе с обязательствами перед бюджетом. По словам руководства ЦБ, они готовы возложить на себя такие серьезные обязательства.