Существование нескольких налоговых ставок по НДС неизбежно приводит к спорам по их применению и негативным последствиям, в том числе отказу в вычете или возмещении НДС.
В частности, в подп. 1 п. 1 ст. 164 НК РФ предусмотрено применение нулевой ставки в отношении реализации товаров на экспорт, а также товаров, помещенных под таможенный режим свободной таможенной зоны.
В абзаце втором подп. 2 п. 1 ст. 164 НК РФ приведен перечень работ (услуг) в отношении вывозимых за пределы России или ввозимых на территорию России товаров, по которым также предусмотрена нулевая ставка. Но! В этой взаимосвязанной норме не указаны конкретные таможенные режимы ввоза.
Так какая же налоговая ставка НДС должна применяться к работам и услугам, связанным с ввозом товаров в Россию в таможенном режиме выпуска в свободное обращение?
В постановлении ФАС Дальневосточного округа от 29.04. 2009 N Ф03-1608/2009 было признано, что приведенный в п. 2 ст. 164 НК РФ перечень работ (услуг), облагаемых по ставке 0 процентов, касается только тех работ (услуг), которые непосредственно связаны с реализацией товаров, вывезенных в таможенном режиме экспорта, а также товаров, помещенных под таможенный режим свободной таможенной зоны. Исходя из этого суд констатировал, что при ввозе товаров на таможенную территорию России в силу п. 5 ст. 164 НК РФ должна применяться налоговая ставка в 18%, если только данные товары не помещались ни под таможенный режим экспорта, ни под таможенный режим свободной экономической зоны (пп. 1 п. 1 ст. 164 НК РФ).
Определением ВАС РФ от 18.08. 2009 N ВАС-8133/09 указанный налоговый спор был вынесен на рассмотрение Президиума ВАС РФ - "в целях формирования единообразного толкования и применения норм права по данной проблеме", поскольку существовала различная арбитражная практика:
- если ФАС Северо-Западного округа на основании указанных норм права при схожих обстоятельствах пришел к выводу о том, что организация, оказавшая услуги по хранению ввозимых товаров, должна выставлять покупателю счет-фактуру с учетом суммы НДС по налоговой ставке 18%: постановления от 29.01.2008, 05.06.2008, 09.06.2008, 01.09.2008 по делам соответственно N А56-49723/2006, N А56-16679/2007, N А56-10390/2007, N А56-10392/2007 Арбитражного суда по городу Санкт-Петербургу и Ленинградской области;
- то другие суды не связывали применение абзаца второго подп. 2 п. 1 ст. 164 НК РФ с конкретным таможенным режимом: постановления ФАС Московского округа от 11.07.2008 и от 17.12.2008 по делам N А40-64933/07-35-364, N А40-64610/07-128-379 Арбитражного суда города Москвы, постановление ФАС Дальневосточного округа от 01.07.2009 по делу N А51-10863/2008 Арбитражного суда Приморского края, постановление ФАС Северо-Западного округа от 13.07.2007 по делу N А42-5777/2006 Арбитражного суда Мурманской области.
В результате Президиум Высшего арбитражного суда РФ в постановлении от 08.12.2009 N 8133/09 констатировал, что услуги по хранению товаров, ввозимых на территорию Российской Федерации, на складах временного хранения, также комплекс услуг по организации выгрузки и транспортировки до выпуска в свободное обращение подлежат обложению НДС по налоговой ставке в 18%. По мнению суда, в данных случаях не применялся ни один из таможенных режимов, упоминаемых в подп. 1 п. 1 ст. 164 НК РФ (экспорта или свободной таможенной зоны).
Исходя из этого можно сказать, что в России одним "белым пятном" в налогообложении НДС стало меньше, поскольку Высшим арбитражным судом сформирована четкая позиция: подп. 1 и подп. 2 п. 1 ст. 164 НК РФ подлежат применению только в совокупности - с учетом только двух таможенных режимов (экспорта и свободной таможенной зоны).