С 2009 по 2011 год возглавляет Первый департамент Азии внешнеполитического ведомства, а в 2011 году назначен на должность заместителя министра. Он курировал вопросы отношений России со странами Азии.
Моргулов также занимает пост спецпредставителя президента России на переговорах по заключению российско-японского мирного договора, а также является председателем Межведомственной комиссии по обеспечению участия Российской Федерации в деятельности Шанхайской организации сотрудничества (ШОС).
Игорь Моргулов имеет дипломатический ранг чрезвычайного и полномочного посла, награжден орденами Почета, Дружбы, Александра Невского и медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени.
Владеет китайским и английским языками, является заместителем председателя Общества российско-китайской дружбы.
В июне Моргулов заявил, что "линия США на раскол российско-китайских отношений заведомо обречена на провал". По его словам, в Москве ценят, что "Пекин с самого начала занял непредвзятую позицию по украинскому вопросу, а китайские друзья осуждают НАТО за искусственное создание кризиса безопасности в Европе и неоправданное расширение блока на восток".