Нестерову вменяют злоупотребление должностными полномочиями.
По данным следствия, занимаясь контролем над местным самоуправлением, Нестеров, руководствуясь личной выгодой, способствовал назначению руководителем одной из районных администраций региона представителя бизнеса.
Из состава правительства области фигурант вышел в декабре 2025 года после изменений в руководстве региональных властей и впоследствии стал главой Совета муниципальных образований Ивановской области.