Он обвиняется по части 4 статьи 159 УК РФ - в мошенничестве в особо крупном размере. За такое преступление предусматривается лишение свободы до 10 лет. По версии следствия, с февраля 2010 года по июнь 2011 года Попельнюхов в составе организованной группы совершил хищение у "Рособоронэкспорта" больше миллиарда рублей из денег, выделенных на строительство заводов по лицензионному производству автоматов АК-103 и патронов к ним.
Уголовное дело в отношении бывшего сенатора и коммерсанта возбудило МВД по материалам оперативной разработки сотрудников управления "П" ФСБ России 30 апреля 2015 года. 12 мая предприниматель был задержан в московской квартире. Бизнесмену было предъявлено обвинение в хищении путем мошенничества. Сам обвиняемый свою вину не признает, заявляя, что он действовал "исключительно в правовых рамках".