В полиции исключили версию теракта. По словам священника Николауса Бальдрмана, трагедия разыгралась около 13.30 по местному времени. Один из преступников угрожал пастору в проходе огнестрельным оружием, у другого в руках имелся железный прут. Уже войдя в храм, двое преступников напали на других священнослужителей, связав их и нанеся ранения. Известно, что тяжелые ранения получили пятеро монахов.
Преступники ограбили церковь, вынеся религиозную утварь, а затем заперли раненых в церкви. Любопытно, что значительные силы венской полиции были незадолго до трагедии направлены к венскому собору Святого Стефана, о заминировании которого чуть ранее сообщил неизвестный.