От обычных "двоек" такие бронемашины отличаются усиленным бронированием. Так, боковые проекции прикрыты бронированными экранами, защищающими не только ходовую часть, но и борта. При этом десант сохранил возможность вести огонь из личного оружия через восемь амбразур. На корме башни смонтирована дополнительная стальная плита.
Из-за возросшей угрозы подрывов на минах и фугасах были проведены работы по усилению днища.
После всех нововведений боевая масса возросла на 500 кг - до 14,5 тонны. БМП утратила возможность плавать, но может преодолевать вброд реки и водоемы глубиной до 1,2 метра.
Поскольку удельная мощность снизилась, уменьшилась и максимальная скорость - до 62 км/ч.
Запас хода по топливу - 600 километров. Штатное вооружение - 30-мм скорострельная пушка, 7,62-мм спаренный пулемет и комплекс управляемого противотанкового вооружения "Конкурс". В качестве дополнительного огневого средства используется автоматический 30-мм гранатомет АГС-17 "Пламя". Экипаж - три человека, десант - семь.
На вооружении сухопутных войск Киргизии имеется 90 БМП-2, данные о том, сколько из них являются "афганскими вариантами", официально не обнародовались.